17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2371 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  949    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  67.26 
 
 
465 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  56.38 
 
 
470 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  32.71 
 
 
463 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  32.87 
 
 
463 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  32.68 
 
 
520 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  32.48 
 
 
474 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  29.26 
 
 
463 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  29.49 
 
 
463 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  27.03 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  41.88 
 
 
447 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  27.97 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  22.82 
 
 
563 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  30.73 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  24.3 
 
 
489 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  28.75 
 
 
521 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  24.07 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>