29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1477 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  919    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  96.76 
 
 		 463 aa  893    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  58.32 
 
 		 474 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  55.82 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  56.04 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  50.42 
 
 		 520 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  44.58 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  33.56 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  30.45 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  29.44 
 
 		 482 aa  190  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  24.25 
 
 		 478 aa  96.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  27.95 
 
 		 509 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  32.06 
 
 		 447 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  26.47 
 
 		 663 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  21.68 
 
 		 579 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  25.24 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  22.31 
 
 		 586 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  26.3 
 
 		 659 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  20.9 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  19.83 
 
 		 785 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  27.31 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  23.73 
 
 		 562 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  25.64 
 
 		 525 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  20.36 
 
 		 546 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  21.85 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  22.32 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  25.88 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1992  hypothetical protein  24.86 
 
 		 283 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  19.6 
 
 		 489 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>