28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2911 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  957    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  45.03 
 
 		 509 aa  312  9e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  41.67 
 
 		 525 aa  275  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  43.11 
 
 		 455 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  35.12 
 
 		 563 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  33.48 
 
 		 489 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  35.87 
 
 		 489 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  36.43 
 
 		 521 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  36.88 
 
 		 486 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  31.99 
 
 		 481 aa  120  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  28.11 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  38.76 
 
 		 476 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  25 
 
 		 474 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  22.11 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  23.21 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  24.79 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  24.76 
 
 		 509 aa  55.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  21.86 
 
 		 463 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  23.48 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  26.15 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  27.63 
 
 		 659 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  27.16 
 
 		 541 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  27.73 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  32.46 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  22.58 
 
 		 663 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  29.8 
 
 		 548 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  24.15 
 
 		 463 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  27.64 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>