25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5084 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1010    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  42.71 
 
 		 489 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  34.3 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  31.16 
 
 		 563 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  36.52 
 
 		 525 aa  140  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  26.3 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  28.85 
 
 		 494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  31.09 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  32.23 
 
 		 509 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  33.12 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  33.83 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  25.81 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  25.81 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  23.04 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  25.34 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  24.23 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  23.55 
 
 		 548 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  23.58 
 
 		 541 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  26.33 
 
 		 562 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  22.62 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  30.11 
 
 		 663 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  25 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  26.3 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  35.29 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  25.75 
 
 		 546 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>