21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1346 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  100 
 
 
509 aa  986    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  45.12 
 
 
494 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  40.08 
 
 
525 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  45.37 
 
 
455 aa  243  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  33.54 
 
 
563 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  34.26 
 
 
489 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  33.65 
 
 
489 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  36.65 
 
 
521 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  32.39 
 
 
486 aa  116  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  29.95 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  40.79 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  31.03 
 
 
506 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  27.51 
 
 
541 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  27.57 
 
 
478 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  28.21 
 
 
548 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  29.41 
 
 
546 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  26.17 
 
 
463 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  26.17 
 
 
463 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  31.4 
 
 
447 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  25.22 
 
 
474 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  27.93 
 
 
482 aa  43.9  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>