28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  100 
 
 		 525 aa  1027    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  40.46 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  38.32 
 
 		 563 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  41.44 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  41.63 
 
 		 455 aa  251  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  35.14 
 
 		 489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  33.48 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  35.41 
 
 		 521 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  30.41 
 
 		 481 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  32.63 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  33.57 
 
 		 506 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  24.94 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  23.75 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  28.33 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  25.12 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  26.43 
 
 		 474 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  26.08 
 
 		 659 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  30.59 
 
 		 663 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  26.32 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  24.26 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  24.15 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  21.28 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  24.48 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  26.72 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  35.53 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  26.62 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  30.49 
 
 		 562 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  25.65 
 
 		 498 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>