21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3886 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  84.15 
 
 		 579 aa  885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  100 
 
 		 586 aa  1173    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  30.06 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  24.39 
 
 		 520 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  25.13 
 
 		 546 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  24.83 
 
 		 474 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  23.26 
 
 		 463 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  23.39 
 
 		 463 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  25.1 
 
 		 541 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  24.02 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  27.65 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  27.35 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  25.5 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  23.03 
 
 		 785 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  26.83 
 
 		 659 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  25.69 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  25.85 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  24.45 
 
 		 548 aa  50.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  26.86 
 
 		 525 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1992  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  26.27 
 
 		 521 aa  43.5  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>