12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1336 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  100 
 
 
785 aa  1585    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  27.61 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  26.82 
 
 
474 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  20.59 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  23.37 
 
 
579 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  20.29 
 
 
463 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  21.31 
 
 
463 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  21.12 
 
 
463 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  22.7 
 
 
586 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  22.12 
 
 
498 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  23.97 
 
 
548 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  24.7 
 
 
525 aa  45.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>