29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1915 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  946    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  58.32 
 
 		 463 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  58.32 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  59.12 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  58.68 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  53.73 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  45.58 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  35.28 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  31.78 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  32.79 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  25.38 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  34.02 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  24.04 
 
 		 586 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  21.98 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  27.54 
 
 		 663 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  25.51 
 
 		 785 aa  74.7  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  27.05 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  28.12 
 
 		 659 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  23.85 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  28.88 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  22.97 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  25.87 
 
 		 521 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  30.14 
 
 		 563 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  25.38 
 
 		 548 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  28.24 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  27.96 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  25.24 
 
 		 494 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1992  hypothetical protein  25.7 
 
 		 283 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  22.1 
 
 		 489 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>