26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0753 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  100 
 
 		 659 aa  1301    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  45.28 
 
 		 663 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4410  hypothetical protein  75.29 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  24.01 
 
 		 520 aa  87  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  28.12 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  26.3 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  25.72 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  30.05 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  22.97 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  28.28 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  28.44 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  28.44 
 
 		 463 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  26.61 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  28.05 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  22.78 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  27.82 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  26.19 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  29.33 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  21.46 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  31.98 
 
 		 486 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  29.82 
 
 		 563 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  24.09 
 
 		 562 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  35.86 
 
 		 481 aa  53.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  31.68 
 
 		 455 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  26.92 
 
 		 465 aa  51.2  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  29.43 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>