26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4411 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  100 
 
 		 663 aa  1337    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  45.28 
 
 		 659 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4410  hypothetical protein  41.47 
 
 		 355 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  26.47 
 
 		 463 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  25.98 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  27.54 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  22.8 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  23.44 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  31.72 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  27.27 
 
 		 463 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  27.27 
 
 		 463 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  30.81 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  26.92 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  35.04 
 
 		 481 aa  55.8  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  25.22 
 
 		 563 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  27.35 
 
 		 521 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  23.65 
 
 		 509 aa  54.7  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  30.32 
 
 		 486 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  24.37 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  26.34 
 
 		 546 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  39.53 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 455 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  24.29 
 
 		 541 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 489 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  21.65 
 
 		 478 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  30 
 
 		 476 aa  44.3  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>