29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1451 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  96.76 
 
 
463 aa  893    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  100 
 
 
463 aa  919    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  58.32 
 
 
474 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  55.82 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  55.6 
 
 
463 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  50 
 
 
520 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  44.58 
 
 
498 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  33.56 
 
 
470 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  30.45 
 
 
465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  29.67 
 
 
482 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  24.46 
 
 
478 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  27.56 
 
 
509 aa  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  32.54 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  22.07 
 
 
579 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  22.7 
 
 
586 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  25.98 
 
 
663 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  24.76 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  25.72 
 
 
659 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  21.7 
 
 
541 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  19.83 
 
 
785 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  26.85 
 
 
521 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  25.64 
 
 
525 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  21.68 
 
 
562 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  22.52 
 
 
563 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  20.13 
 
 
489 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  21.74 
 
 
494 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  24.69 
 
 
506 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1992  hypothetical protein  23.66 
 
 
283 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  21.71 
 
 
489 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>