23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0720 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  59.59 
 
 
541 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1144    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  49.44 
 
 
546 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  41.1 
 
 
548 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26411  hypothetical protein  34.29 
 
 
542 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2372  hypothetical protein  35.4 
 
 
543 aa  258  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  25.44 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  25.55 
 
 
586 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  22.47 
 
 
663 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  25.44 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  25.44 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  24.18 
 
 
659 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  28.02 
 
 
525 aa  62  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  26.88 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  22.12 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  24.37 
 
 
463 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  24.37 
 
 
521 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  25.71 
 
 
481 aa  54.7  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  23.53 
 
 
563 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  26.17 
 
 
506 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  28.68 
 
 
579 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  22.32 
 
 
520 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  26.14 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>