20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1526 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1110    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  54.38 
 
 		 541 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  49.44 
 
 		 562 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  39.33 
 
 		 548 aa  340  5e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2372  hypothetical protein  34.71 
 
 		 543 aa  260  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26411  hypothetical protein  33.77 
 
 		 542 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  25.31 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  25.23 
 
 		 579 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  26.38 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  24.15 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  21.19 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  23.45 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  24.78 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  23.45 
 
 		 463 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  20.36 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  26.75 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  27.2 
 
 		 663 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  27.27 
 
 		 486 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  23.47 
 
 		 509 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  23.73 
 
 		 563 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>