31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2177 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  925    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  99.35 
 
 
463 aa  922    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  58.68 
 
 
474 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  55.82 
 
 
463 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  55.6 
 
 
463 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  48.52 
 
 
520 aa  450  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  42.13 
 
 
498 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  34.87 
 
 
470 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  32.63 
 
 
482 aa  217  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  32.14 
 
 
465 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  31.48 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  25.44 
 
 
478 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  26.04 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  24.79 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  28.73 
 
 
579 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  24.31 
 
 
509 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  28.14 
 
 
586 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  24.89 
 
 
562 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  21.08 
 
 
785 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  26.61 
 
 
563 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  22.91 
 
 
489 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  24.01 
 
 
546 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  27.98 
 
 
455 aa  60.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  24.15 
 
 
525 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  22.96 
 
 
489 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  27.59 
 
 
521 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  28.44 
 
 
659 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
663 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  27.7 
 
 
506 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1992  hypothetical protein  28.5 
 
 
283 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  27.5 
 
 
486 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>