21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  100 
 
 		 455 aa  877    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  40.99 
 
 		 525 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  42.71 
 
 		 494 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  43.59 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  34.38 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  35.04 
 
 		 489 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  37.97 
 
 		 521 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  30.54 
 
 		 489 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  36.04 
 
 		 481 aa  113  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  38.41 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  43.03 
 
 		 476 aa  97.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  34.7 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  28.64 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  27.09 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  31.98 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  26.18 
 
 		 541 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  27.55 
 
 		 659 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  28.36 
 
 		 474 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  24.58 
 
 		 498 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  28.64 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  24.78 
 
 		 463 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>