23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0363 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  100 
 
 		 486 aa  930    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  42.86 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  32.87 
 
 		 489 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  32.4 
 
 		 525 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  35.37 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  34.43 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  33.33 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  30 
 
 		 563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  29.36 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  28.8 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  30.95 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  34.75 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  24.61 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  29.67 
 
 		 663 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  27.46 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  21.57 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  28.7 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  28.7 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  37.72 
 
 		 659 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  23.9 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  30.3 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  27.21 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  29.12 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>