26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5205 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  100 
 
 		 521 aa  1037    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  38.22 
 
 		 563 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  34.96 
 
 		 525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  37.09 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  37.16 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  33.69 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  35.96 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  29.9 
 
 		 489 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  30.8 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  28.9 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  30.53 
 
 		 506 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  38.03 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  26.33 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  27.06 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  24.36 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  27.09 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  25.33 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  22.47 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  27.09 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  25.21 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  25.14 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  27.35 
 
 		 663 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  28.75 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  26.13 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  24.37 
 
 		 562 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  28.89 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>