80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4062 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  100 
 
 
350 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  37.86 
 
 
347 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  39.22 
 
 
355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  40.24 
 
 
354 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  36.63 
 
 
342 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  37.79 
 
 
359 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  38.51 
 
 
355 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  37.68 
 
 
341 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  37.32 
 
 
350 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  35.53 
 
 
331 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  36.86 
 
 
355 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  35.9 
 
 
337 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  37.43 
 
 
356 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  37.32 
 
 
347 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  35.98 
 
 
355 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  35.41 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  35.9 
 
 
355 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  37.85 
 
 
357 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  34.86 
 
 
327 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  35.65 
 
 
358 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  35.82 
 
 
349 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  34.59 
 
 
352 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  34.07 
 
 
334 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  38.24 
 
 
376 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  35.84 
 
 
335 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  33.63 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  32.78 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  34.77 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  35.38 
 
 
356 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  35.38 
 
 
356 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  34.2 
 
 
358 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  35.36 
 
 
376 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  32.93 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  34.53 
 
 
376 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  34.26 
 
 
346 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  33.43 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  29.68 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  27.15 
 
 
354 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  26.87 
 
 
359 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  26.35 
 
 
371 aa  99.4  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  29.53 
 
 
332 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  29.19 
 
 
332 aa  96.3  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  26.12 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  27.06 
 
 
362 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  25.69 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  25.69 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  24.3 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  27.8 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  25.37 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  26.06 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  26.09 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  25.91 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  23.36 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  26.01 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  25.07 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  22.39 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  23.99 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  25.08 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  23.66 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  27.3 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  22.78 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  24.31 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  23.86 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  26.39 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  25.46 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 
362 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  23.1 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  28.14 
 
 
349 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  23.1 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  23.68 
 
 
364 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  25.81 
 
 
368 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  24.07 
 
 
317 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  20.31 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  20.62 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  18.94 
 
 
328 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  22.53 
 
 
315 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  20 
 
 
328 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>