82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2364 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  100 
 
 
368 aa  744    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  37.54 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  39.23 
 
 
336 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  34.21 
 
 
366 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  34.58 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  33.33 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  33.13 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  33.43 
 
 
367 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  30.51 
 
 
328 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  32.01 
 
 
328 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  32.26 
 
 
380 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  32.07 
 
 
333 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  30.07 
 
 
328 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  30.24 
 
 
329 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  30.41 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  30.07 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  32.68 
 
 
363 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  30.07 
 
 
328 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  32.33 
 
 
362 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  29.73 
 
 
328 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  29.73 
 
 
328 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  29.05 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  30.68 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  29.22 
 
 
330 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  29.22 
 
 
330 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  28.39 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  30.6 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  28.87 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  28.57 
 
 
363 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  28.57 
 
 
363 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  28.8 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  28.57 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  30.51 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  30.06 
 
 
315 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  28.71 
 
 
317 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  27.97 
 
 
326 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  28.71 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  28.48 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  28.41 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  28.41 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  28.36 
 
 
337 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  28.57 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  27.9 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  28.7 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  26.46 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  27.78 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  29.15 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  23.87 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  25.83 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  28.45 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  26.63 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  25.77 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  28.33 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  26.69 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  28.06 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  27.12 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  22.88 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  27.25 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  27.5 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  25.65 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  26.04 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  25.88 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  24.47 
 
 
429 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  27.36 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  26.17 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  26.25 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  25.93 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  29.47 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  23.99 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  23.08 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  24.41 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  24.61 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  28.07 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  25 
 
 
346 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  26.33 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  25.5 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  27.74 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  22.58 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  25.27 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  26.62 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  26.02 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  32.29 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>