80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1884 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 335 aa  692    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  77.61 
 
 		 358 aa  548  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  53.12 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  51.95 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  52.54 
 
 		 427 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  51.65 
 
 		 355 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  51.83 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  51.04 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  49.85 
 
 		 376 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  51.35 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  48.8 
 
 		 347 aa  332  5e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  51.34 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  50.9 
 
 		 354 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  49.85 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  49.39 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  50 
 
 		 331 aa  322  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  49.54 
 
 		 358 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  50.61 
 
 		 357 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  49.11 
 
 		 356 aa  321  9.000000000000001e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  50.91 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  49.24 
 
 		 358 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  47.58 
 
 		 352 aa  316  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  47.85 
 
 		 337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  47.4 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  46.95 
 
 		 349 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  46.63 
 
 		 331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  47.15 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  44.34 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  44.34 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  48 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  47.43 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  39.94 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  45.39 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  38.98 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  35.84 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  36.59 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  31.81 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  27.93 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  36.91 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  30.25 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  30.25 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  25.8 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  26.49 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  27.08 
 
 		 366 aa  99.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  28.76 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  24.25 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  29.71 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  29.43 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  27.06 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  25 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  26.52 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  25.95 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  27.5 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  23.49 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  24.93 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  23.26 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  23.49 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  26.98 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  23.49 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  23 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  29.74 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  25.15 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  24.07 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  23.73 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  24.07 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  25.54 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  23.73 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  23.87 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  23.39 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  26.33 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  23.39 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  23.39 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  22.33 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  21.81 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  21.12 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  24.33 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  22.15 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  27.56 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  29.92 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  22.65 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>