84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2387 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  100 
 
 
352 aa  724    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  80.46 
 
 
350 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  68.1 
 
 
347 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  60.46 
 
 
359 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  61.33 
 
 
356 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  58.36 
 
 
355 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  57.91 
 
 
355 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  60.49 
 
 
357 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  61.7 
 
 
355 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  58.33 
 
 
376 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  57.49 
 
 
350 aa  411  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  59.39 
 
 
354 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  59.63 
 
 
341 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  59.21 
 
 
355 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  55.37 
 
 
355 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  58.41 
 
 
327 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  55.99 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  56.27 
 
 
331 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  52.71 
 
 
358 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  53.22 
 
 
358 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  53.07 
 
 
331 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  54.55 
 
 
427 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  53.94 
 
 
358 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  50.6 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  49.13 
 
 
356 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  49.13 
 
 
356 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  51.49 
 
 
334 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  51.21 
 
 
376 aa  346  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  52.01 
 
 
376 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  47.43 
 
 
358 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  47.58 
 
 
335 aa  316  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  41.1 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  41.88 
 
 
342 aa  258  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  37.39 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  34.59 
 
 
350 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  35.2 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  33.23 
 
 
354 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  29.55 
 
 
358 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  26.57 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  30.31 
 
 
332 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  30.53 
 
 
332 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  27.38 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  29.31 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  29.2 
 
 
371 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  26.54 
 
 
363 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  27.71 
 
 
362 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  28.83 
 
 
333 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  26.1 
 
 
401 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  26.93 
 
 
367 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  24.24 
 
 
373 aa  95.9  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  26.54 
 
 
366 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  25.08 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  25.94 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  25.94 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  25.6 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  25.6 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  25.26 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  25.26 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  26.6 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  23.85 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  24.52 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  23.55 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  24.84 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  27.2 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  24.38 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  24.38 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  24.38 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  24.69 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  24.59 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  25.22 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  24.58 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  28.5 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  21.94 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  26.81 
 
 
326 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  25.58 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  25.51 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  22.77 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  21.75 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  21.75 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  22.22 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  26.77 
 
 
349 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  21.12 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  21.54 
 
 
325 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  22.88 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>