86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0747 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 347 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  47.42 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  46.79 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  46.5 
 
 		 355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  45.43 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  46.04 
 
 		 337 aa  288  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  46.2 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  45.87 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  44.85 
 
 		 376 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  46.95 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  45.33 
 
 		 342 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  45.09 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  48 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  44.98 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  43.87 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  44.44 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  45.29 
 
 		 341 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  43.5 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  43.66 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  43.16 
 
 		 331 aa  270  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  43.02 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  41.1 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  42.33 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  39.88 
 
 		 350 aa  259  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  42.02 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  42.02 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  40.96 
 
 		 358 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  40.94 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  40.94 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  37.86 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  42.94 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  39.47 
 
 		 346 aa  235  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  42.36 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  41.1 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  38.98 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  39.65 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  29.17 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  29.61 
 
 		 371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  29.94 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  27.46 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  29.69 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  31.7 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  32.03 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  30.13 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  31.55 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  30.65 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  29.47 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  28.05 
 
 		 367 aa  99.4  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  26.79 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  28.93 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  27.36 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  26.96 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  27.36 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  26.73 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  27.04 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  27.04 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  27.36 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  26.73 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  25.79 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  25.08 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  22.26 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  28.27 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  27.01 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  27.21 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  26.32 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  26.28 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  24.29 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  24.29 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  25.3 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  22.56 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  25.48 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  24.43 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  24.04 
 
 		 329 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  24.1 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  20.65 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  24.1 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  24.1 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  24.1 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  22.78 
 
 		 429 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  24.35 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  22.15 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  36.11 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  22.49 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  21.94 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  24.88 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  21.63 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>