84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2225 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  100 
 
 
358 aa  743    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  64.74 
 
 
356 aa  474  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  64.74 
 
 
356 aa  474  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  58.88 
 
 
347 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  58.62 
 
 
355 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  54.76 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  56.25 
 
 
354 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  57.02 
 
 
359 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  57.83 
 
 
350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  56.23 
 
 
355 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  59.44 
 
 
327 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  56.36 
 
 
337 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  54.8 
 
 
358 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  52.92 
 
 
376 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  54.8 
 
 
358 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  56.46 
 
 
356 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  54.11 
 
 
355 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  55.46 
 
 
427 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  56.31 
 
 
331 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  53.94 
 
 
352 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  55.38 
 
 
355 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  56.92 
 
 
357 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  55.25 
 
 
341 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  54.6 
 
 
349 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  52.76 
 
 
331 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  50.85 
 
 
350 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  50.9 
 
 
334 aa  355  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  50.27 
 
 
376 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  49.33 
 
 
376 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  47.42 
 
 
358 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  47.15 
 
 
335 aa  308  9e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  40.96 
 
 
347 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  39.33 
 
 
342 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  41.19 
 
 
346 aa  238  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  32.93 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  35.54 
 
 
311 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  31.73 
 
 
354 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  29.41 
 
 
358 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  25.76 
 
 
359 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  33.33 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  34.18 
 
 
332 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  34.18 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  28.25 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  30.12 
 
 
394 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  30.33 
 
 
333 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  27.48 
 
 
369 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  27.02 
 
 
401 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  25.29 
 
 
366 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  25.36 
 
 
362 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  27.27 
 
 
367 aa  96.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  25.61 
 
 
363 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  27.54 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  23.89 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  23.08 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  24.44 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  23.79 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  24.91 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  24.08 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  22.68 
 
 
397 aa  63.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  24.08 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  22.7 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 
328 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  23.17 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  22.98 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  21.64 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  21.99 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  21.99 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  21.99 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  22.36 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  22.36 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  22.03 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  22.67 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  21.77 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  22.36 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  22.36 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  23.81 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  21.48 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  23.08 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  21.71 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  19.88 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  26.15 
 
 
359 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  30.65 
 
 
429 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  28.7 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  21.29 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>