85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2943 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  100 
 
 
346 aa  724    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  44.2 
 
 
355 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  41.69 
 
 
354 aa  249  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  41.27 
 
 
355 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  42.5 
 
 
355 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  43 
 
 
356 aa  245  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  45.39 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  41.93 
 
 
355 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  43.23 
 
 
355 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  42.39 
 
 
358 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  39.47 
 
 
347 aa  235  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  41.79 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  41.67 
 
 
376 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  41.19 
 
 
358 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  39.44 
 
 
347 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  41.72 
 
 
334 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  41.37 
 
 
331 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  40.12 
 
 
327 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  39.18 
 
 
311 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  42.24 
 
 
342 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  42.38 
 
 
357 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  39.94 
 
 
358 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  41.69 
 
 
427 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  41.31 
 
 
349 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  39.16 
 
 
358 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  37.39 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  39.93 
 
 
337 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  39.54 
 
 
350 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  41.35 
 
 
356 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  41.35 
 
 
356 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  39.4 
 
 
341 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  37.77 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  37.3 
 
 
331 aa  206  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  38.67 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  37.18 
 
 
376 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  34.26 
 
 
350 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  34.74 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  31.13 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  31.44 
 
 
358 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  27.39 
 
 
359 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  28.85 
 
 
332 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  26.27 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  28.75 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  28.52 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  31.33 
 
 
369 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  25.83 
 
 
401 aa  86.3  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  28.05 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  26.8 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  23.46 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  26.42 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  23.04 
 
 
363 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  26.36 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  25 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  23.34 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  25.32 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  26.15 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  24.62 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  22.71 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  36.54 
 
 
349 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  21.8 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  21.8 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  22.15 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  21.8 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  23.89 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  21.75 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  23.08 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  24.64 
 
 
368 aa  60.1  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  23.23 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  23.85 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  23.68 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  23.33 
 
 
380 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  23.69 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  22.77 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  23.38 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  23.38 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  23.64 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  23.64 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  22.43 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  24.08 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  27.88 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  23.34 
 
 
325 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  21.78 
 
 
364 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  21.97 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  23.23 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  22.94 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>