87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3497 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  90.14 
 
 		 355 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 355 aa  727    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  83.94 
 
 		 355 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  74.08 
 
 		 355 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  71.55 
 
 		 355 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  72.01 
 
 		 354 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  70.66 
 
 		 356 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  70.52 
 
 		 376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  70.52 
 
 		 359 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  71.43 
 
 		 350 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  71.25 
 
 		 357 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  71.08 
 
 		 341 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  67.18 
 
 		 327 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  63.76 
 
 		 358 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  65.34 
 
 		 337 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  63.76 
 
 		 358 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  67.79 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  64 
 
 		 331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  61.19 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  57.64 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  58.76 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  59.31 
 
 		 376 aa  418  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  58.38 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  60.17 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  55.62 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  54.25 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  54.76 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  52.99 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  52.99 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  51.14 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  51.51 
 
 		 335 aa  340  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  46.5 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  42.46 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  42.5 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  35.9 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  37.42 
 
 		 311 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  28.49 
 
 		 358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  31.63 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  30.16 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  28.88 
 
 		 362 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  31.48 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  30.86 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  30.29 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  27.62 
 
 		 363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  27.24 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  27.05 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  27.09 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  29.6 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  28.27 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  27.71 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  25.4 
 
 		 397 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  25.16 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  24.2 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  26.59 
 
 		 380 aa  86.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  23.5 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  24.52 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  24.76 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  24.44 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  25.42 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  24.76 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  24.44 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  24.44 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  25.96 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  24.75 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  23.51 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  26.89 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  22.93 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  25.97 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  24 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  22.76 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  21.75 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  24.75 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  23.27 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  24.66 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  24.41 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  24.41 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  24.41 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  22.83 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  25 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  22 
 
 		 429 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  20.86 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  20.86 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  25.34 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  21.5 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  25.55 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  24.61 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  30.56 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>