47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5941 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  100 
 
 
349 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  36.54 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  33.59 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  33.86 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  34.86 
 
 
357 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  33.6 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  36.11 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  34.21 
 
 
401 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  31.48 
 
 
356 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  28.95 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  27.27 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  26.77 
 
 
352 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  34.86 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  30.97 
 
 
349 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  28.14 
 
 
350 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  25.29 
 
 
342 aa  50.4  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  28.24 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  33.33 
 
 
373 aa  49.3  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  31.78 
 
 
427 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  29.17 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  28.95 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  31.19 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  31.48 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  30.56 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  31.48 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  31.07 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  32.41 
 
 
369 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  26.79 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  35.19 
 
 
336 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  32.11 
 
 
359 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  33.64 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  28.7 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  29.92 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  31.48 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  32.73 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  31.36 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  26.82 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2394  hypothetical protein  22.75 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  26.32 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  27.48 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  27.48 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  29.53 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  28.7 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03815  hypothetical protein  25.84 
 
 
557 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  28.71 
 
 
367 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  30.56 
 
 
355 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  29.37 
 
 
311 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>