85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02193 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  753    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  69.44 
 
 
362 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  41.98 
 
 
367 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  40.91 
 
 
401 aa  250  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  40.54 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  39.29 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  39.51 
 
 
333 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  36.6 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  35.51 
 
 
336 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  34.02 
 
 
328 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  34.98 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  35.29 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  35.29 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  34.31 
 
 
328 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  34.98 
 
 
328 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  34.98 
 
 
328 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  34.06 
 
 
328 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  35.29 
 
 
328 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  32.75 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  32.21 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  32.42 
 
 
326 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  33.02 
 
 
325 aa  160  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  31.05 
 
 
373 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  31.23 
 
 
380 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  31.35 
 
 
330 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  31.35 
 
 
330 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  30.84 
 
 
333 aa  153  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  33 
 
 
363 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  30.47 
 
 
397 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  32.67 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  32.43 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  32.43 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  32.4 
 
 
362 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  31.69 
 
 
315 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  30.42 
 
 
326 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  32.74 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  35.62 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  28.48 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  29.5 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  27.76 
 
 
316 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  29.46 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  28.87 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  28.49 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  27.75 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  28.4 
 
 
356 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  29.71 
 
 
355 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  27.86 
 
 
355 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  27.66 
 
 
350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  26.21 
 
 
350 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  28.91 
 
 
354 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  26.54 
 
 
352 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  27.51 
 
 
359 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  27.19 
 
 
358 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  26.84 
 
 
341 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  27.09 
 
 
376 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  29.52 
 
 
376 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  28.99 
 
 
376 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  26.29 
 
 
358 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  26.51 
 
 
356 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  26.51 
 
 
356 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  26.49 
 
 
335 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  27.68 
 
 
357 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  26.32 
 
 
337 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  25.29 
 
 
358 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  28.93 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  25.43 
 
 
342 aa  96.3  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  26.12 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  25.08 
 
 
308 aa  94  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  26.16 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  25.93 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  25.3 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  26.06 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  24.94 
 
 
429 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  25.61 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  25.5 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  26.21 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  26.74 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  26.21 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  23.62 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  26.89 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  23.04 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  25.09 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  23.23 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  22.71 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  24 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>