88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1745 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  100 
 
 
350 aa  722    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  73.52 
 
 
359 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  72.75 
 
 
376 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  72.95 
 
 
355 aa  510  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  70.18 
 
 
354 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  68.91 
 
 
355 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  69.59 
 
 
355 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  71.56 
 
 
355 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  67.52 
 
 
355 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  70.21 
 
 
356 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  72 
 
 
341 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  68.62 
 
 
327 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  67.08 
 
 
337 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  64.99 
 
 
358 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  66.67 
 
 
357 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  64.69 
 
 
358 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  63.89 
 
 
331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  62.77 
 
 
331 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  60.47 
 
 
347 aa  431  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  56.1 
 
 
352 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  61 
 
 
427 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  58.95 
 
 
376 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  59.23 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  54.42 
 
 
350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  57.78 
 
 
358 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  55.06 
 
 
356 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  55.06 
 
 
356 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  53.64 
 
 
349 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  54.49 
 
 
334 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  49.86 
 
 
358 aa  331  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  50.91 
 
 
335 aa  321  9.000000000000001e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  44.98 
 
 
347 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  41 
 
 
342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  37.32 
 
 
350 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  39.54 
 
 
346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  36.82 
 
 
311 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  32.91 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  28.57 
 
 
358 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  27.5 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  30.27 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  29.57 
 
 
332 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  29.86 
 
 
332 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  29.03 
 
 
363 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  28.17 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  27.78 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  29.02 
 
 
394 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  28.9 
 
 
333 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  27.9 
 
 
401 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  30.18 
 
 
367 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  27.15 
 
 
369 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  27.83 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  25.28 
 
 
373 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  27.49 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  27.95 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  26.05 
 
 
336 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  27.18 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  24.83 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  28.61 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  28.61 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  26.69 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  24.32 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  28.31 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  28.27 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  24.58 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  24.66 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  25 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  23.99 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  25.8 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  25.9 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  23.05 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  24.58 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  25.88 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  24.24 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  24.24 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  24.24 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  24.1 
 
 
361 aa  63.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  33.59 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  22.11 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  24.69 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  21.85 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  23.92 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  23.92 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  21.77 
 
 
315 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  28.07 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  23.79 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3872  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  29.8 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  22 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0671  peptidase C45, acyl-coenzyme A - 6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  37.5 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>