86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3412 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 357 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  69.44 
 
 		 356 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  68.99 
 
 		 376 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  69.8 
 
 		 355 aa  507  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  68.56 
 
 		 355 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  68.38 
 
 		 355 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  71.34 
 
 		 355 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  66.67 
 
 		 355 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  68.21 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  68.33 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  67.17 
 
 		 350 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  65.95 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  63.11 
 
 		 337 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  63.61 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  61.54 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  61.54 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  60.06 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  63.11 
 
 		 331 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  59.54 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  59.2 
 
 		 331 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  57.6 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  59.72 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  58.38 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  55.52 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  55.56 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  54.13 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  54.78 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  54.78 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  55.19 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  51.16 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  50.74 
 
 		 335 aa  326  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  46.95 
 
 		 347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  41.44 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  42.62 
 
 		 346 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  35.94 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  35.71 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  34.73 
 
 		 354 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  28.7 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  28.89 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  32.11 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  31.8 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  31.27 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  30.96 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  27.25 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  30.46 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  28.49 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  27.45 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  28.76 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  28.65 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  25.21 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  28.12 
 
 		 401 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  27.83 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  25.53 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  25.15 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  27.8 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  25.67 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  23.62 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  25.48 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  25.48 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  25.81 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  25.48 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  25.48 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  23.97 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  23.6 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  24.82 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  23.29 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  23.6 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  24.1 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  23.59 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  23.15 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  23.29 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  23.29 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  22.67 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  24.66 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  23.91 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  23.25 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  25.35 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  34.86 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  23.03 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  23.03 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  21.24 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  23.45 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  25 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  20.89 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  21.7 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4392  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  25.45 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>