80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1652 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 363 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  99.72 
 
 		 363 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  99.45 
 
 		 363 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  99.45 
 
 		 362 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  99.17 
 
 		 363 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  42.74 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  41.4 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  40.22 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  35 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  29.39 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  32.67 
 
 		 363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  29.65 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  29.46 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  29.63 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  28.61 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  28.88 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  29.25 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  27.75 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  28.8 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  28.49 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  27.6 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  27.44 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  27.92 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  26.35 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  25.55 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  29.72 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  27.11 
 
 		 328 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  27.11 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  26.76 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  26.76 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  25.09 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  25.27 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  25.08 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  27.25 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  25.08 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  24.32 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  26.91 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  26.91 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  25.78 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  27.1 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  24.51 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  26.24 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  31.25 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  23.55 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  25.31 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  23.86 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  24.05 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  24.05 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  24.38 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  27.3 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  27.33 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  26.1 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  25.08 
 
 		 357 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  25.56 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  23.31 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  24.1 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  24.59 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  24.26 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  24.09 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  21.8 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  22.61 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  24.3 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  24.55 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  23.72 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  23.53 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  21.99 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  24.88 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  22.62 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  23.86 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  25.49 
 
 		 308 aa  54.3  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  22.3 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  21.25 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  23.81 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  21.88 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  21.07 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  25.31 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  23.2 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  27.07 
 
 		 359 aa  42.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>