30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0681 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  100 
 
 		 359 aa  752    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  34.96 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  28.2 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  28.5 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  29.47 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  29.74 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  30.04 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  24.89 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  29.58 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  24.44 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  25.62 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  27.03 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  27.35 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  24.05 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  24.05 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  28.22 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  26.51 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  25.54 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  23.66 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  26.21 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  27.91 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  26.15 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  22.63 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  24.62 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  26.97 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  25.31 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  25.31 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  25.31 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  24.09 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  23.95 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>