59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2805 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 361 aa  756    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  34.96 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  26.36 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  25.35 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  26.67 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  27.2 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  23.16 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  23.16 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  27.5 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  24.16 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  29.89 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  26.75 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  26.15 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  26 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  26.59 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  25.38 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  24.42 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  26.29 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  24.23 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  22.56 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  22.87 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  26.11 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  24.32 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  23.55 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  25.26 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  23.93 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  22.18 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  24.65 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  24.27 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  25.45 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  26.69 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  22.9 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  22.87 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  22.3 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  25.11 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  24.24 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  24 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  22.78 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  26.64 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  24.31 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  25.22 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  26.34 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  23.45 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  23.38 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  22.14 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  23.38 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  25.95 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  24.88 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  23.38 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  20.88 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  23.38 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  23.08 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  23.08 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  20.75 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  24.9 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  20.41 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  22.94 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  22.14 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  24.91 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>