83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2991 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  89.36 
 
 		 376 aa  678    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 376 aa  778    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  61.68 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  62.13 
 
 		 355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  64.08 
 
 		 355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  61.37 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  59.52 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  60.87 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  58.73 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  59.34 
 
 		 359 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  60.34 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  60 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  60.69 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  59.37 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  60.63 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  57.35 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  54.37 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  57.18 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  54.84 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  54.34 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  53.03 
 
 		 331 aa  378  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  54.37 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  48.78 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  52.01 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  50 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  51.58 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  49.86 
 
 		 334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  50 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  50 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  46.95 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  48.29 
 
 		 335 aa  308  6.999999999999999e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  40.46 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  42.94 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  37.18 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  35.36 
 
 		 350 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  34.9 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  31.12 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  28.75 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  27.04 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  33.33 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  32.84 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  32.55 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  29.79 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  27.93 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  29.03 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  29.6 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  30.12 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  26.99 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  27.25 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  27.41 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  27.96 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  25.94 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  28.37 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  25.55 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  25.83 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  27.05 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  24.37 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  24.3 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  24.3 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  24.3 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  24.3 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  22.77 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  26.64 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  22.53 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  22.84 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  22.53 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  22.22 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  22.46 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  22.53 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  22.22 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  22.22 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  24.51 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  23.83 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  24.19 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  24.19 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  26.44 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  24.23 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  25.2 
 
 		 317 aa  53.5  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  30.91 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  21.81 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  23.79 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  24.8 
 
 		 325 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  26.04 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>