63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3411 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 358 aa  750    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  58.71 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  42.78 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  29.94 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  28.49 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  29.79 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  29.3 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  28.57 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  28.57 
 
 		 355 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  29.52 
 
 		 354 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  31.02 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  29.29 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  29.29 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  28.43 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  30.88 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  28.98 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  29.63 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  29.55 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  29.75 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  28.21 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  27.87 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  28.13 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  27.75 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  29.41 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  27.79 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  28.65 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  27.93 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  27.93 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  29.13 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  28.86 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  28.71 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  28.79 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  28.82 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  31.44 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  29.68 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  29.94 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  25.8 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  27.71 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  27.41 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  26.89 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  30.89 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  29.44 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  27.63 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  21.35 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  24.71 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  24.71 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  23.57 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  28.67 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  23.75 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  23.81 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  23.81 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  23.81 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  23.81 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  23.37 
 
 		 373 aa  49.7  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  23.05 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  21.83 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  24.17 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  21.54 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  21.54 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  21.59 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  23.6 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>