81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0697 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  100 
 
 
334 aa  690    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  63.03 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  54.93 
 
 
337 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  55.22 
 
 
359 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  53.73 
 
 
327 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  53.27 
 
 
355 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  54.76 
 
 
355 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  54.46 
 
 
355 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  52.54 
 
 
331 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  54.17 
 
 
376 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  54.49 
 
 
350 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  55.19 
 
 
357 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  51.35 
 
 
347 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  52.54 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  52.54 
 
 
355 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  51.96 
 
 
358 aa  354  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  51.04 
 
 
331 aa  353  2e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  51.04 
 
 
356 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  51.95 
 
 
335 aa  351  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  50.6 
 
 
358 aa  349  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  51.49 
 
 
352 aa  347  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  51.64 
 
 
354 aa  346  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  48.66 
 
 
358 aa  345  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  48.66 
 
 
358 aa  345  8e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  50.6 
 
 
341 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  49.25 
 
 
350 aa  341  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  48.96 
 
 
356 aa  338  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  48.96 
 
 
356 aa  338  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  48.22 
 
 
349 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  49.86 
 
 
376 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  49.29 
 
 
376 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  43.66 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  38.71 
 
 
342 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  41.72 
 
 
346 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  34.07 
 
 
350 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  37.12 
 
 
311 aa  198  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  30.05 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  38.57 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  25.8 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  38.17 
 
 
332 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  37.63 
 
 
332 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  24.73 
 
 
359 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  28.3 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  34.57 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  34.57 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  25.89 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  25.5 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  24.01 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  24.47 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  25.54 
 
 
401 aa  79.3  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  26.32 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  24.33 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2805  choloylglycine hydrolase  24.16 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  27.3 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  22.98 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  22.85 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  22.26 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  24.04 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  22.26 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  22.55 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  22.26 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  22.26 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  25.5 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  23.87 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  23.87 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  21.5 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  25 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  23.79 
 
 
429 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  22.92 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0681  penicillin V acylase-like protein  28.22 
 
 
359 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.219585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  22.19 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  22.37 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  21.07 
 
 
363 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  21.07 
 
 
363 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  21.07 
 
 
362 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  21.07 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  23.83 
 
 
317 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  21.07 
 
 
363 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  21.6 
 
 
325 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  22.45 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  23.94 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>