65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4492 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  100 
 
 		 354 aa  742    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  42.78 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  42.18 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  31.83 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  32.27 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  32.27 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  31.81 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  34.19 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  34.73 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  32.91 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  32.27 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  31.91 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  32.27 
 
 		 355 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  31.63 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  33.97 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  33.23 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  31.63 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  32.27 
 
 		 354 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  29.58 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  27.97 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  32.15 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  31.31 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  30.05 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  32.38 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  30.35 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  31.95 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  34.08 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  30.03 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  33.54 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  31.73 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  31.19 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  28.01 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  31.12 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  29.09 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  31.13 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  29.17 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  28.03 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  26.11 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  27.15 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  29.8 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  30.2 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  30.47 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  23.68 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  22.71 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  26.17 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  22.71 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  24.05 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  21.97 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  26.87 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  23.28 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  25.11 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  24.33 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  24.33 
 
 		 394 aa  49.7  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  24.39 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  24.39 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  24.04 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  24.04 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  24.04 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  22.58 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  22.58 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  23.73 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  28.23 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  22.88 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  21.77 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  22.84 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>