82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0536 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  100 
 
 
317 aa  664    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  58.54 
 
 
315 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  43.67 
 
 
316 aa  267  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  36.28 
 
 
329 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  36.16 
 
 
325 aa  205  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  31.53 
 
 
328 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  31.21 
 
 
328 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  34.78 
 
 
325 aa  189  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  30.89 
 
 
328 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  30.57 
 
 
328 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  30.57 
 
 
328 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  30.57 
 
 
328 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  30.57 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  30.57 
 
 
328 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  30.57 
 
 
328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  30.34 
 
 
394 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  30.34 
 
 
333 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  31.48 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  30.65 
 
 
369 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  27.13 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  31.15 
 
 
366 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  28.79 
 
 
401 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  28.48 
 
 
363 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  29.41 
 
 
362 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  31 
 
 
326 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  27.11 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  26.33 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  28.53 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  27.12 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  27.12 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  28.61 
 
 
336 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  28.71 
 
 
368 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  28.62 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  25.25 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  25.77 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  25.27 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  25.78 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  25.78 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  25.57 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  25.78 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  25.78 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  25.78 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  23.75 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  25.25 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  25.66 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  22.74 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  22.44 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  24.01 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  24.76 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  21.85 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  22.76 
 
 
355 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  24.5 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  21.59 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  21.57 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  23.85 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  21.82 
 
 
355 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  22.01 
 
 
354 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  22.15 
 
 
347 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  22.8 
 
 
355 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  21.81 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  22.48 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  23.66 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  22.58 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  24.05 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  22.66 
 
 
356 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  22.66 
 
 
356 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  21.5 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  22.85 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  20.9 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  22.95 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  22.76 
 
 
427 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  25.2 
 
 
376 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  21.7 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  24.6 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  21.12 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  21.71 
 
 
358 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  23.83 
 
 
334 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  24.07 
 
 
350 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  23.42 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  23.42 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  23.37 
 
 
429 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>