72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  100 
 
 
315 aa  653    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  58.54 
 
 
317 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  45.25 
 
 
316 aa  269  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  38.54 
 
 
329 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  37.66 
 
 
325 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  36.63 
 
 
328 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  36.3 
 
 
328 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  35.97 
 
 
328 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  35.97 
 
 
328 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  35.97 
 
 
328 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  35.97 
 
 
328 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  35.64 
 
 
328 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  34.98 
 
 
328 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  36.08 
 
 
325 aa  200  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  34.65 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  31.27 
 
 
333 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  31.79 
 
 
401 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  32.11 
 
 
367 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  31.17 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  31.17 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  29.85 
 
 
369 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  32.51 
 
 
366 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  31.69 
 
 
363 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  29.01 
 
 
362 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  28.12 
 
 
336 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  25 
 
 
330 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  25 
 
 
330 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  26.23 
 
 
326 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  27.9 
 
 
326 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  25.53 
 
 
373 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  30.06 
 
 
368 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  28.12 
 
 
326 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  27.84 
 
 
308 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  27.14 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  24.72 
 
 
397 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  25.55 
 
 
364 aa  82.4  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  25.56 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  25.56 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  25.56 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  25.56 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  25.56 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  23.79 
 
 
355 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  24.92 
 
 
337 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  24.04 
 
 
371 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  23.32 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  23.15 
 
 
355 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  22.83 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  22.43 
 
 
346 aa  55.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  23.4 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  21.77 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  21.94 
 
 
347 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  23.15 
 
 
359 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  21.61 
 
 
341 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  22.58 
 
 
358 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  22.52 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  22.56 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  24.14 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  22.68 
 
 
355 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  24.14 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  22.36 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  22.61 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  23.11 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  22.15 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  21.85 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  25.99 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  25 
 
 
331 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  24.91 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  23.13 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  23.13 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  27.07 
 
 
427 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  22.53 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  21.29 
 
 
358 aa  42.7  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>