More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_48200  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
265 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000881528  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0008  enoyl-CoA hydratase  53.03 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5490  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.34 
 
 
268 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0010  enoyl-CoA hydratase  51.72 
 
 
267 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0859138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3988  enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 
263 aa  258  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2314  enoyl-CoA hydratase  54.58 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27360  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826772  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0959  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.7 
 
 
262 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.189039  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2844  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
259 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
264 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.461474  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1197  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4945  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
271 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.8 
 
 
152 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
321 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00572297  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6177  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
262 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.69 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
269 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.77 
 
 
255 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.77 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
287 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.77 
 
 
255 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
270 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
261 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
253 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
247 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
247 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
247 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
256 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 
258 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.62 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.62 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
254 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
234 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
254 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.17 
 
 
257 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
256 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 
261 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
265 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 
261 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  29.32 
 
 
261 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  27.84 
 
 
259 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
258 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
255 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2610  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
257 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0699041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 
257 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
256 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
258 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
258 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
256 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
257 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 
256 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2709  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
257 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
254 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
257 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3963  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
254 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
259 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>