More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6285 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48200  enoyl-CoA hydratase  72.8 
 
 
265 aa  193  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000881528  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5490  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.96 
 
 
268 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0008  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
268 aa  156  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0010  enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 
267 aa  152  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0859138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27360  enoyl-CoA hydratase  59.52 
 
 
263 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826772  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2314  enoyl-CoA hydratase  58.73 
 
 
263 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3988  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
263 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0959  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.73 
 
 
262 aa  137  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.189039  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48 
 
 
264 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.461474  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2844  enoyl-CoA hydratase  46.97 
 
 
259 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1197  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.78 
 
 
271 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4945  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.88 
 
 
271 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
321 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00572297  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6177  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
262 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
258 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.42 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 
256 aa  72  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
257 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
257 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
257 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
257 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5078  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  44.87 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
261 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
265 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.69 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  32.54 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.15 
 
 
257 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
255 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.85 
 
 
257 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
257 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
258 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
256 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
257 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
257 aa  63.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  37.72 
 
 
289 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
259 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
257 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
263 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
247 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
266 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
291 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 
259 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
260 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
247 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
247 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
267 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
261 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
254 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
257 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
259 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
257 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 
259 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
257 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
261 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
258 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
254 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  44.16 
 
 
258 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
274 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
266 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
264 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
248 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
294 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 
264 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.56 
 
 
257 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
257 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
259 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
274 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
257 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0214  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.83 
 
 
696 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  43.42 
 
 
258 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
258 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
259 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.43 
 
 
257 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.25 
 
 
260 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12846  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 
249 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000117946  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
262 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
262 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
263 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
268 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.86 
 
 
260 aa  60.5  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.86 
 
 
260 aa  60.5  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
259 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
261 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>