More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3988 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3988  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27360  enoyl-CoA hydratase  69.47 
 
 		 263 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2314  enoyl-CoA hydratase  68.7 
 
 		 263 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5490  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.85 
 
 		 268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48200  enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000881528  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0959  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.25 
 
 		 262 aa  248  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.189039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0008  enoyl-CoA hydratase  48.44 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2844  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0010  enoyl-CoA hydratase  47.27 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0859138 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.461474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1197  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.52 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4945  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.56 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6177  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.03 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00572297  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.94 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.57 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  34.75 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  29.21 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  33.98 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.41 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.07 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.74 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.74 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  33.98 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.68 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.7 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.68 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.01 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.43 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.07 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  33.72 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.28 
 
 		 657 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>