More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6177 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6177  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 262 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5490  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.461474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1197  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0010  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0859138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4945  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2844  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2314  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27360  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0008  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3988  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0959  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.189039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48200  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000881528  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 		 321 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00572297  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2709  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.79 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  28.62 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2610  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0699041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.12 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.85 
 
 		 657 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  29.43 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.79 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.12 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  29.18 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.3 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.57 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.4 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.85 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.03 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.38 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.57 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.31 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  25.88 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  29.18 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.41 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  27.72 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.36 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.65 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>