More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4945 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4945  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
271 aa  550  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1197  enoyl-CoA hydratase/isomerase  83.4 
 
 
271 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.32 
 
 
264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.461474  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5490  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.79 
 
 
268 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27360  enoyl-CoA hydratase  51.54 
 
 
263 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826772  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2314  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 
263 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0959  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.56 
 
 
262 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.189039  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0010  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
267 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0859138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2844  enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 
259 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0008  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
268 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3988  enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6177  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
262 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48200  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
265 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000881528  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
321 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00572297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  139  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
270 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 
273 aa  131  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
269 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
269 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
269 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
261 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  30.95 
 
 
272 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 
262 aa  126  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
257 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
257 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
287 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
271 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
264 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  37.32 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  33.21 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
261 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  34.22 
 
 
262 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
260 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
259 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3478  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.35 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0451778  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  31.95 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 
265 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
279 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
253 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  31.95 
 
 
261 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.14 
 
 
267 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 
260 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  29.67 
 
 
296 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
254 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  31.95 
 
 
261 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.15 
 
 
261 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 
258 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
259 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
258 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
261 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  31.15 
 
 
261 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  31.2 
 
 
261 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
263 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
273 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>