More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0655 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0655  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
335 aa  696    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2436  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  46.89 
 
 
344 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.02 
 
 
547 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2021  cysteine synthase  43.29 
 
 
375 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2157  cysteine synthase  43.29 
 
 
375 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2001  cysteine synthase  43.29 
 
 
375 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1970  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  40.31 
 
 
336 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1397  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  40 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2123  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  40 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2508  cysteine synthase  40 
 
 
354 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2561  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  40 
 
 
354 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1621  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  40 
 
 
336 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3191  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  40 
 
 
336 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2647  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  40 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  39.12 
 
 
379 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.67 
 
 
368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.36 
 
 
393 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.36 
 
 
371 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.36 
 
 
371 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  35.27 
 
 
388 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  44.19 
 
 
756 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.17 
 
 
369 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.17 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  37.2 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.17 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.7 
 
 
371 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2603  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.99 
 
 
378 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2310  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.78 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.46 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4585  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.78 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7558  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  35.19 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  31.99 
 
 
341 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  31.73 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  35.16 
 
 
338 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  35.02 
 
 
320 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.77 
 
 
326 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.77 
 
 
326 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.1 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  35.91 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  33.7 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.16 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  34.12 
 
 
304 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  31.88 
 
 
304 aa  126  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  31.37 
 
 
312 aa  126  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  31.37 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  32.95 
 
 
309 aa  125  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  32.35 
 
 
454 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  34.75 
 
 
320 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.58 
 
 
333 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  31.32 
 
 
351 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  29.29 
 
 
345 aa  122  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.97 
 
 
330 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  31.5 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  34.11 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  26.64 
 
 
461 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  32.43 
 
 
320 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  33.2 
 
 
304 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  29.92 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  33.58 
 
 
317 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  30.26 
 
 
333 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  29.28 
 
 
707 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.16 
 
 
363 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  32.67 
 
 
308 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  35.09 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  34.55 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  29.48 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2443  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.34 
 
 
340 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.67 
 
 
459 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.41 
 
 
330 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  33.58 
 
 
308 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  28.62 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  31.39 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.67 
 
 
459 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.57 
 
 
459 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  32.42 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  35.16 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  29.84 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  28.32 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  30.98 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  32.05 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  31.39 
 
 
311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.64 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.95 
 
 
685 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  30.59 
 
 
305 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.93 
 
 
465 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  31.7 
 
 
315 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  30.2 
 
 
305 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  32.82 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  32.57 
 
 
306 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  30.62 
 
 
307 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  29.59 
 
 
316 aa  113  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  28.31 
 
 
479 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  30.83 
 
 
302 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  32.08 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  34.62 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  34.91 
 
 
310 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.58 
 
 
325 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  30.89 
 
 
305 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  34.25 
 
 
311 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0642  cysteine synthase  33.85 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.220278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>