More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2310 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4585  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  98.81 
 
 
335 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7558  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2310  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 
335 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  67.38 
 
 
379 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  66.88 
 
 
372 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  64.72 
 
 
393 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  64.13 
 
 
371 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  64.13 
 
 
371 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  66.87 
 
 
368 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  66.26 
 
 
369 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  65.95 
 
 
369 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  65.95 
 
 
369 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2603  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.39 
 
 
378 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  64.56 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  63.83 
 
 
371 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2436  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  39.39 
 
 
344 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.77 
 
 
547 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  39.3 
 
 
756 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1970  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  35.71 
 
 
336 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2647  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.64 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2508  cysteine synthase  34.64 
 
 
354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1397  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.64 
 
 
354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2123  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.64 
 
 
354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3191  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.64 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921178  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1621  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.64 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2561  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.64 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2021  cysteine synthase  35.36 
 
 
375 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2157  cysteine synthase  34.98 
 
 
375 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2001  cysteine synthase  34.98 
 
 
375 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0655  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.78 
 
 
335 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.33 
 
 
333 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  32.86 
 
 
372 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  34.15 
 
 
341 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  34.98 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.1 
 
 
326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.1 
 
 
326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  34.15 
 
 
340 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.93 
 
 
330 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  33.57 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  36.03 
 
 
351 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.94 
 
 
336 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  32.47 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  32.98 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  30.99 
 
 
707 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.25 
 
 
363 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  28.42 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.93 
 
 
685 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  30.66 
 
 
464 aa  126  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.98 
 
 
307 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  30.1 
 
 
333 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.04 
 
 
307 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.18 
 
 
330 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  33.21 
 
 
305 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  33.21 
 
 
305 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.43 
 
 
453 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  30.53 
 
 
340 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  29.9 
 
 
461 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  32.98 
 
 
305 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.91 
 
 
456 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  31.93 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  33.58 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  27.45 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.96 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31 
 
 
465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  29.67 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  31.75 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  30.66 
 
 
312 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  30.29 
 
 
458 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  29.89 
 
 
302 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  33.69 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.11 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  32.51 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  33.46 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  35.36 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.55 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  28.83 
 
 
306 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  33.33 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  34.42 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  34.42 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.68 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  34.42 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  34.42 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  32.73 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  34.42 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  29.63 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  28.33 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  34.42 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  34.42 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  32.2 
 
 
459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  31.21 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  31.91 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  32.48 
 
 
307 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0633  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  31.83 
 
 
336 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  29.67 
 
 
312 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.48 
 
 
307 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  32.13 
 
 
303 aa  113  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  30.99 
 
 
310 aa  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  30.63 
 
 
307 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  30.61 
 
 
315 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  32.48 
 
 
307 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3903  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.72 
 
 
338 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>