More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1929 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1929  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 274 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0100  alpha/beta hydrolase fold protein  48.63 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.15 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  41.77 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  40.79 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3427  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3869  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  37.17 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  40.91 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  34.23 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.71 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  33 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  40 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.53 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  40.51 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  37.76 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  21.6 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.89 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 288 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 315 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  38.96 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  37.96 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  29.73 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  29.73 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  29.73 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.73 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  43.37 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  29.73 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  22.46 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  29.73 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  34.33 
 
 		 350 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>