More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4026 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.46 
 
 
262 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
271 aa  92  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  24.79 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0100  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  28.25 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
246 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  32.12 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.23 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.66 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  28.99 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.91 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  22.36 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.91 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.91 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  22.96 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  28.89 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
256 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 
261 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
307 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
278 aa  58.9  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
277 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  31.06 
 
 
334 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  32.26 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  33.59 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.88 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.08 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  34.4 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.53 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  25.11 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  38.53 
 
 
316 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.91 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 
317 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  35.92 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  37.61 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.71 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  33.64 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
255 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
275 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.71 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>