More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1591 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  100 
 
 
334 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  51.1 
 
 
322 aa  330  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  43.03 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  35.22 
 
 
662 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.5 
 
 
345 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.84 
 
 
349 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  34.64 
 
 
336 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  32.08 
 
 
347 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  35.45 
 
 
356 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  35.25 
 
 
338 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  34.15 
 
 
373 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
341 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  34.78 
 
 
347 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.56 
 
 
349 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  32.17 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  32.99 
 
 
349 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  32.07 
 
 
361 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  34.24 
 
 
341 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.43 
 
 
358 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.75 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  32.94 
 
 
365 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.16 
 
 
353 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.25 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  29.22 
 
 
349 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
352 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  32 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  31.02 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  30.94 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  33.45 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  32.34 
 
 
343 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  32.39 
 
 
359 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  30.7 
 
 
339 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  30.49 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  29.97 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  30.2 
 
 
332 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.12 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.32 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  30.96 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  27.47 
 
 
346 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  33.01 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  27.81 
 
 
316 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  36.44 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  29.62 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  31.88 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  29.62 
 
 
359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  29.62 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  30.71 
 
 
325 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  30.36 
 
 
325 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  27.3 
 
 
350 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  28.17 
 
 
318 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.47 
 
 
347 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  31.14 
 
 
316 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  29.64 
 
 
324 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  30.3 
 
 
321 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  30.3 
 
 
321 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  30.3 
 
 
321 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  29.59 
 
 
330 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
315 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  27.91 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  32.09 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  31.85 
 
 
300 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  27.52 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  32.76 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  27.49 
 
 
330 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  31.09 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  27.61 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.75 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.12 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.85 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  26.85 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.08 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 
671 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.37 
 
 
324 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.37 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  31.15 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.88 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.88 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.88 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.16 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  24.49 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  24.49 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2423  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929009  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  25.64 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.73 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.73 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  23 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  23 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  32.72 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.16 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  26.82 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  23.13 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  21.04 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  28.48 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  21.04 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  30 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  21.04 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>