283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0807 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  100 
 
 
343 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  39.21 
 
 
662 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.2 
 
 
345 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  38.36 
 
 
347 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  36.69 
 
 
356 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  37.66 
 
 
351 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  38.14 
 
 
344 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  35.78 
 
 
341 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  34.21 
 
 
349 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  32.45 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  34.79 
 
 
361 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  34.77 
 
 
336 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.78 
 
 
349 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  32.85 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  33.14 
 
 
322 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  31.61 
 
 
341 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  34.97 
 
 
351 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  32.46 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.23 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  35.05 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.83 
 
 
353 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  32.33 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  30.56 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  29.53 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  35.28 
 
 
321 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  35.28 
 
 
321 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  35.28 
 
 
321 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.75 
 
 
358 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  31.63 
 
 
324 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  32.42 
 
 
341 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  33.89 
 
 
349 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  33.04 
 
 
316 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  32.04 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  31.61 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.82 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  32.25 
 
 
325 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  31.92 
 
 
325 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
349 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  31.94 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  31.37 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  32.66 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.22 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.7 
 
 
348 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
365 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.43 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  30.22 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  27.66 
 
 
350 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  34.21 
 
 
338 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  33.48 
 
 
342 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  31.32 
 
 
354 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  33.53 
 
 
357 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  30.11 
 
 
352 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  30.85 
 
 
330 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.03 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.03 
 
 
322 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  29.02 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.34 
 
 
321 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.62 
 
 
321 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  25.42 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.85 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.85 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.4 
 
 
321 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.4 
 
 
321 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  24.84 
 
 
324 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  25.83 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  27.56 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  27.56 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  27.56 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.23 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  34.95 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  27.14 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.26 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  29.93 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  29.03 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  27.37 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3501  periplasmic binding protein  35.26 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.897036  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  27.13 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  29.03 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  32.11 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.72 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  36.13 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  26.32 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  26.32 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  23.84 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  26.32 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  25.82 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  36.48 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  24.56 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  25.88 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  32.8 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  27.07 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  24.64 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  31.61 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>